机关三党总支于2017年8月由学院党委会研究设立，其职能是统管我院后勤管理处、财务处、国资设备处和基建办四个行政部门的党务工作，下辖两个党支部，即由后勤管理处全体党员组成的一支部和由财务处、国资设备处及基建办的全体党员组成的二支部。机关三党总支共计党员22人（一、二个支部各11人），其中院领导1人，处级干部7人，具有副高技术职务7人。其主要职责是抓好党的思想、组织、作风、制度和反腐倡廉建设，发挥党总支的政治核心作用、党支部的战斗堡垒作用和党员的先锋模范作用，以确保各项工作的正常运行和学院的发展。